MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/11023 chromosome

Total Repeats: 20277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017431	ATG	2	6	1336	1341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241360
2	NC_017431	GTG	2	6	1342	1347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385241360
3	NC_017431	TCC	2	6	1351	1356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385241360
4	NC_017431	AGC	2	6	1365	1370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241360
5	NC_017431	T	6	6	1384	1389	0 %	100 %	0 %	0 %	385241360
6	NC_017431	AGC	2	6	1392	1397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241360
7	NC_017431	AAG	2	6	1403	1408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241360
8	NC_017431	TAC	2	6	1441	1446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241360
9	NC_017431	GCT	2	6	1451	1456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241360
10	NC_017431	AGTA	2	8	1489	1496	50 %	25 %	25 %	0 %	385241360
11	NC_017431	AGA	2	6	1561	1566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241360
12	NC_017431	AGA	2	6	1817	1822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241361
13	NC_017431	ATC	2	6	1824	1829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241361
14	NC_017431	TGC	2	6	1844	1849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241361
15	NC_017431	ATGA	2	8	1893	1900	50 %	25 %	25 %	0 %	385241361
16	NC_017431	GATA	2	8	1931	1938	50 %	25 %	25 %	0 %	385241361
17	NC_017431	CAT	2	6	1968	1973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241361
18	NC_017431	AGA	2	6	1997	2002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241361
19	NC_017431	AAG	2	6	2026	2031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241361
20	NC_017431	GGA	2	6	2061	2066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385241361
21	NC_017431	AG	3	6	2153	2158	50 %	0 %	50 %	0 %	385241362
22	NC_017431	ATC	2	6	2190	2195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241362
23	NC_017431	TTTC	2	8	2228	2235	0 %	75 %	0 %	25 %	385241362
24	NC_017431	ATA	2	6	2340	2345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241362
25	NC_017431	AAC	2	6	2365	2370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241362
26	NC_017431	GGT	2	6	2419	2424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385241362
27	NC_017431	AAT	2	6	2525	2530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241362
28	NC_017431	TTC	2	6	2560	2565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241362
29	NC_017431	GCA	2	6	2579	2584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241362
30	NC_017431	GGA	2	6	2627	2632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385241362
31	NC_017431	CAG	2	6	2646	2651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241362
32	NC_017431	GTT	2	6	2663	2668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241362
33	NC_017431	GGT	2	6	2755	2760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385241362
34	NC_017431	GA	3	6	2821	2826	50 %	0 %	50 %	0 %	385241362
35	NC_017431	T	6	6	2828	2833	0 %	100 %	0 %	0 %	385241362
36	NC_017431	AAG	2	6	2913	2918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241362
37	NC_017431	ATT	2	6	2975	2980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241362
38	NC_017431	TTG	2	6	3027	3032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241362
39	NC_017431	CATG	2	8	3109	3116	25 %	25 %	25 %	25 %	385241362
40	NC_017431	AAG	2	6	3138	3143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241362
41	NC_017431	AAG	2	6	3153	3158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241362
42	NC_017431	CAG	2	6	3195	3200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241362
43	NC_017431	GCT	2	6	3266	3271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241362
44	NC_017431	TGTGA	2	10	3281	3290	20 %	40 %	40 %	0 %	385241362
45	NC_017431	TTCC	2	8	3414	3421	0 %	50 %	0 %	50 %	385241362
46	NC_017431	AAG	2	6	3432	3437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241362
47	NC_017431	CAG	2	6	3482	3487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241362
48	NC_017431	GGA	2	6	3569	3574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385241362
49	NC_017431	AAT	2	6	3579	3584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241362
50	NC_017431	TTGAA	2	10	3637	3646	40 %	40 %	20 %	0 %	385241363
51	NC_017431	ATT	2	6	3659	3664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241363
52	NC_017431	TGA	2	6	3689	3694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241363
53	NC_017431	TTTA	2	8	3812	3819	25 %	75 %	0 %	0 %	385241363
54	NC_017431	GTA	2	6	3921	3926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241363
55	NC_017431	GAGAA	2	10	3931	3940	60 %	0 %	40 %	0 %	385241363
56	NC_017431	AGA	2	6	3968	3973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241363
57	NC_017431	ATCC	2	8	4112	4119	25 %	25 %	0 %	50 %	385241363
58	NC_017431	GAA	2	6	4152	4157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241363
59	NC_017431	CGT	2	6	4284	4289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241363
60	NC_017431	A	7	7	4328	4334	100 %	0 %	0 %	0 %	385241363
61	NC_017431	GTT	2	6	4335	4340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241363
62	NC_017431	GAAAA	2	10	4368	4377	80 %	0 %	20 %	0 %	385241363
63	NC_017431	A	7	7	4374	4380	100 %	0 %	0 %	0 %	385241363
64	NC_017431	TGA	2	6	4472	4477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241363
65	NC_017431	AT	3	6	4514	4519	50 %	50 %	0 %	0 %	385241363
66	NC_017431	TTACA	2	10	4523	4532	40 %	40 %	0 %	20 %	385241363
67	NC_017431	TTG	2	6	4567	4572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241363
68	NC_017431	TTC	2	6	4708	4713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241363
69	NC_017431	TCT	2	6	4800	4805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241363
70	NC_017431	AGA	2	6	4820	4825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241363
71	NC_017431	GTT	2	6	4847	4852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241363
72	NC_017431	GACG	2	8	4859	4866	25 %	0 %	50 %	25 %	385241363
73	NC_017431	GGT	2	6	4895	4900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385241363
74	NC_017431	AAAGCT	2	12	4941	4952	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385241363
75	NC_017431	TTGG	2	8	4962	4969	0 %	50 %	50 %	0 %	385241363
76	NC_017431	CTC	2	6	4999	5004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385241363
77	NC_017431	AGC	2	6	5030	5035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241363
78	NC_017431	ATT	2	6	5147	5152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241364
79	NC_017431	TCT	2	6	5165	5170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241364
80	NC_017431	GCT	2	6	5211	5216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241364
81	NC_017431	GTCTT	2	10	5217	5226	0 %	60 %	20 %	20 %	385241364
82	NC_017431	GAT	2	6	5246	5251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241364
83	NC_017431	TC	3	6	5262	5267	0 %	50 %	0 %	50 %	385241364
84	NC_017431	GA	3	6	5273	5278	50 %	0 %	50 %	0 %	385241364
85	NC_017431	ACG	2	6	5284	5289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241364
86	NC_017431	GAA	2	6	5308	5313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241364
87	NC_017431	TGGA	2	8	5321	5328	25 %	25 %	50 %	0 %	385241364
88	NC_017431	AT	3	6	5377	5382	50 %	50 %	0 %	0 %	385241364
89	NC_017431	AGA	3	9	5385	5393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241364
90	NC_017431	GCT	2	6	5394	5399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241364
91	NC_017431	AGA	2	6	5403	5408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241364
92	NC_017431	TGG	2	6	5439	5444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385241364
93	NC_017431	AGA	3	9	5457	5465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241364
94	NC_017431	GGA	2	6	5466	5471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385241364
95	NC_017431	TG	3	6	5530	5535	0 %	50 %	50 %	0 %	385241364
96	NC_017431	T	6	6	5608	5613	0 %	100 %	0 %	0 %	385241364
97	NC_017431	TCA	2	6	5651	5656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241364
98	NC_017431	GGA	2	6	5688	5693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385241364
99	NC_017431	CTTT	2	8	5698	5705	0 %	75 %	0 %	25 %	385241364
100	NC_017431	CTT	2	6	5748	5753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241364
101	NC_017431	CTG	2	6	5754	5759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241364
102	NC_017431	CAG	2	6	5909	5914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241364
103	NC_017431	AG	3	6	5938	5943	50 %	0 %	50 %	0 %	385241364
104	NC_017431	GCA	2	6	5947	5952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241364
105	NC_017431	GGGA	2	8	6213	6220	25 %	0 %	75 %	0 %	385241364
106	NC_017431	AG	3	6	6412	6417	50 %	0 %	50 %	0 %	385241365
107	NC_017431	AGG	2	6	6438	6443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385241365
108	NC_017431	GAA	2	6	6482	6487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241365
109	NC_017431	GGTG	2	8	6516	6523	0 %	25 %	75 %	0 %	385241365
110	NC_017431	AAAT	2	8	6582	6589	75 %	25 %	0 %	0 %	385241365
111	NC_017431	GCA	2	6	6746	6751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241365
112	NC_017431	AAG	2	6	6787	6792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241365
113	NC_017431	TGC	2	6	6820	6825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241365
114	NC_017431	ATTT	2	8	7094	7101	25 %	75 %	0 %	0 %	385241366
115	NC_017431	TTA	2	6	7152	7157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241366
116	NC_017431	ATTT	2	8	7185	7192	25 %	75 %	0 %	0 %	385241366
117	NC_017431	GAA	2	6	7201	7206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241366
118	NC_017431	TCG	2	6	7314	7319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241367
119	NC_017431	TCC	2	6	7357	7362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385241367
120	NC_017431	GTT	2	6	7465	7470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241367
121	NC_017431	AC	3	6	7647	7652	50 %	0 %	0 %	50 %	385241367
122	NC_017431	T	6	6	7683	7688	0 %	100 %	0 %	0 %	385241367
123	NC_017431	TGGTA	2	10	7690	7699	20 %	40 %	40 %	0 %	385241367
124	NC_017431	AAGC	2	8	7820	7827	50 %	0 %	25 %	25 %	385241367
125	NC_017431	TTA	2	6	7835	7840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241367
126	NC_017431	A	6	6	7967	7972	100 %	0 %	0 %	0 %	385241367
127	NC_017431	T	6	6	8052	8057	0 %	100 %	0 %	0 %	385241367
128	NC_017431	TTC	2	6	8158	8163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241367
129	NC_017431	ATTG	2	8	8218	8225	25 %	50 %	25 %	0 %	385241368
130	NC_017431	GAA	2	6	8302	8307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241368
131	NC_017431	AG	3	6	8390	8395	50 %	0 %	50 %	0 %	385241368
132	NC_017431	ACC	2	6	8430	8435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385241368
133	NC_017431	CTT	2	6	8483	8488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241368
134	NC_017431	CT	4	8	8509	8516	0 %	50 %	0 %	50 %	385241368
135	NC_017431	GAG	2	6	8563	8568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385241368
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267	NC_017431	TTA	2	6	14870	14875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241373
268	NC_017431	CTT	2	6	14891	14896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241373
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271	NC_017431	TTTC	2	8	15079	15086	0 %	75 %	0 %	25 %	385241374
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